Ketika kita berbicara tentang ayam, sebagian besar orang mungkin langsung membayangkan hewan ternak yang hidup di pekarangan rumah atau peternakan. Namun, di balik keberadaan ayam peliharaan yang kita kenal sehari hari, terdapat sejarah evolusi dan hubungan kekerabatan yang panjang dan kompleks. Salah satu kunci untuk memahami asal usul ayam modern adalah dengan mempelajari kerabat liar yang masih hidup hingga saat ini, yaitu ayam hutan merah atau Red Jungle Fowl. Hewan ini diyakini sebagai nenek moyang utama dari ayam peliharaan di seluruh dunia.
Sebuah penelitian terbaru yang dilakukan oleh para ilmuwan di Thailand memberikan wawasan penting mengenai hubungan genetika antara ayam lokal Thailand dan ayam hutan merah. Penelitian ini berfokus pada analisis keragaman genetik menggunakan bagian khusus dari DNA yang disebut mtDNA D loop. Bagian DNA ini sangat berguna untuk mempelajari garis keturunan karena diwariskan hanya melalui jalur maternal, yaitu dari induk betina ke anaknya, tanpa bercampur dengan DNA dari jantan.
Baca juga artikel tentang: Antara Iritasi dan Racun: Sains Mengupas Efek Gas Air Mata Kedaluwarsa
Penelitian ini menganalisis empat ras ayam lokal dari Provinsi Narathiwat di Thailand selatan, masing masing adalah Betong, Khao Chang, Sriwijaya Naked Neck, dan Dang. Selain itu, peneliti juga memasukkan sampel ayam hutan merah yang hidup di wilayah selatan Thailand. Dengan membandingkan DNA dari kedua kelompok, para ilmuwan berharap dapat melihat seberapa besar kesamaan dan perbedaan genetika yang dimiliki keduanya.
Para peneliti mengumpulkan 558 fragmen DNA dari bagian D loop mitokondria dan kemudian melakukan proses genotyping, yaitu metode untuk membaca karakter genetik dari masing masing sampel. Dari hasil analisis ditemukan adanya 20 titik variasi genetika dan 23 jenis haplotipe dalam total 326 urutan DNA yang berhasil dianalisis. Haplotype adalah kombinasi variasi DNA yang diwariskan bersama dari satu generasi ke generasi berikutnya. Semakin banyak haplotype, semakin tinggi keragaman genetik suatu populasi.
Salah satu temuan menarik dari penelitian ini adalah tingginya keragaman genetik baik pada ayam lokal maupun ayam hutan merah. Ayam hutan merah memiliki nilai keragaman haplotype sebesar 0.936 dan keragaman nukleotida sebesar 0.00806. Nilai ini cukup tinggi dan menunjukkan bahwa populasi ayam hutan merah di wilayah tersebut memiliki variasi genetika yang luas. Ayam lokal Thailand juga menunjukkan kisaran keragaman genetik yang tinggi, antara 0.9050 untuk haplotype dan hingga 0.00856 untuk keragaman nukleotida.
Keragaman genetik yang tinggi dalam sebuah populasi penting karena menunjukkan bahwa populasi tersebut mempunyai kemampuan adaptasi yang baik terhadap perubahan lingkungan. Populasi dengan variasi genetika luas akan lebih mampu bertahan ketika menghadapi penyakit, perubahan cuaca ekstrem, atau gangguan ekosistem lainnya.
Dalam penelitian ini, para ilmuwan juga menggunakan metode analisis variasi molekuler untuk melihat bagaimana variasi genetik tersebar dalam populasi. Hasilnya menunjukkan bahwa sebagian besar variasi genetik terjadi di dalam populasi itu sendiri, yaitu sekitar 78.20 persen. Hal ini menunjukkan bahwa setiap kelompok ayam lokal maupun ayam hutan merah memiliki perbedaan genetik yang signifikan antara satu individu dengan individu lainnya, tetapi tidak terlalu banyak perbedaan antar kelompok ras.
Langkah berikutnya, para peneliti membuat analisis jaringan median joining dan pohon filogenetik. Analisis ini membantu memperlihatkan hubungan kekerabatan antar haplotype. Dari hasil analisis tersebut diketahui bahwa semua ayam lokal dan ayam hutan merah yang diteliti dapat dikelompokkan ke dalam delapan haplogroup utama, yaitu kelompok A, F, H, dan V, di mana masing masing kelompok haplogroup terdiri dari beberapa haplotype. Kelompok dengan jumlah haplotype terbanyak adalah haplogroup B yang memiliki enam haplotype, disusul oleh haplogroup V dengan lima haplotype.
Temuan yang paling menarik adalah tidak adanya haplogroup yang spesifik untuk satu ras ayam tertentu. Artinya, tidak ada kelompok genetik yang hanya dimiliki oleh satu ras saja. Semua ras ayam lokal dan ayam hutan merah saling berbagi haplogroup yang sama. Hal ini menunjukan bahwa ayam ayam lokal Thailand kemungkinan besar berasal dari beberapa garis ibu yang berbeda, atau dengan kata lain memiliki nenek moyang maternal yang beragam. Keberagaman ini juga menunjukkan bahwa proses domestikasi ayam di Thailand mungkin terjadi melalui banyak peristiwa penyilangan antara ayam hutan dan ayam peliharaan dalam sejarah panjang domestikasi.
Temuan ini bukan hanya penting untuk memahami asal usul ayam peliharaan, tetapi juga memiliki dampak langsung terhadap dunia peternakan modern. Keragaman genetik adalah modal dasar bagi pemuliaan ternak. Semakin tinggi keragaman genetik, semakin besar peluang untuk menghasilkan keturunan ayam dengan kualitas yang lebih baik, seperti ketahanan penyakit, produktivitas tinggi, atau kemampuan adaptasi terhadap lingkungan baru.
Selain itu, penelitian ini membantu melestarikan kekayaan genetika lokal yang sering kali terancam oleh praktik peternakan intensif yang cenderung menyamakan keturunan melalui perkawinan selektif. Mengetahui struktur genetik ayam lokal akan memudahkan upaya konservasi dan menjaga ketahanan populasi ayam dari kepunahan genetis.
Penelitian ini memberikan gambaran besar mengenai hubungan yang erat antara ayam lokal Thailand dan ayam hutan merah. Keduanya memiliki keragaman genetik tinggi, berbagi haplogroup yang sama, serta menunjukkan sejarah evolusi maternal yang saling berhubungan. Hal ini menegaskan bahwa pelestarian ayam hutan merah sebagai nenek moyang ayam modern sangat penting, tidak hanya dari perspektif ekologi tetapi juga dari sudut pandang keberlanjutan peternakan.
Melalui penelitian seperti ini, kita dapat memahami bahwa hewan peliharaan yang terlihat biasa ternyata menyimpan sejarah evolusi yang kaya dan penting. Ayam ayam yang hidup di halaman rumah kita hari ini merupakan hasil perjalanan panjang ribuan tahun, di mana genetika liar dan domestik terus berinteraksi dan beradaptasi. Dengan mengetahui asal usul dan keragaman genetika mereka, kita dapat menghargai lebih dalam hubungan antara manusia, hewan ternak, dan alam.
Baca juga artikel tentang: Dari Pikiran ke Struktur: CBT dan Bukti Baru Neuroplastisitas
REFERENSI:
Maneechot, N dkk. 2025. Genetic Diversity of Native Chicken Populations and Red Jungle Fowl in Southern Thailand Based on Mitochondrial a DNA D-loop Region. Brazilian Journal of Poultry Science 27 (01), eRBCA-2024-2005.
